نقد العقل الاسلامي لا يعني اطلاقاً القيام بعمل سلبي او تدميري كما قد يفهمه البعض . ولا يعني ابداً المس بالتجربة الروحية الكبرى للاسلام الحنيف ، هذه التحربة التي تجلت بعد القرآن الكريم في مؤلفات وشخصيات اسلامية تنتمي الى كافة التجاهات والمذاهب : من سنية وشيعية واباضية ومعتزلة وصوفية وفلاسفة …الخ
وانما هو يعني نقد التجسيد التاريخي والتطبيقي للمبادئ المثالية الروحية . فهناك الوحي وهناك التاريخ ، هناك المثال الأعلى وهنالك التطبيق